Существует два важных вопроса, касающихся вакцинации детей с КД: во-первых, ИВИГ блокирует репликацию живых вирусных вакцин и формирование приобретенного иммунитета, поэтому вакцинацию следует отложить как минимум до 3 месяцев после применения ИВИГ; во-вторых, существует вопрос о безопасности применения живых или других вакцин у детей, выздоравливающих после КД. Некоторые аутоиммунные заболевания, включая системный васкулит, могут внезапно ухудшиться после введения живых или мертвых вакцин, поэтому все вакцинации следует отложить как минимум на 3 месяца после КД. AHA рекомендует отложить вакцинацию против живых некишечных вирусов (корь, паротит и краснуха) как минимум на 5 месяцев после ИВИГ, поскольку антитела пассивного иммунитета могут нарушить иммунологическую функцию иммунологических препаратов. Однако во время вспышек кори следует рано и с осторожностью применять вакцину против кори у детей, не привитых ранее пассивным иммунитетом, и повторить вакцинацию в более поздние сроки. В детском возрасте не следует прерывать другие прививки, а вакцинация против гриппа рекомендуется для снижения частоты развития синдрома Рейе у детей с длительной АГА.