Независимо от того, используется ли операция для лечения туберкулеза позвоночника или нет, медикаментозное лечение туберкулеза является необходимым предоперационным и послеоперационным лечением. Изониазид, рифампицин, пиразинамид и этамбутол — четыре препарата, наиболее часто используемые для лечения. Изониазид и рифампицин являются полными бактерицидными средствами, пиразинамид — полубактерицидным средством, а этамбутол — бактериостатическим средством. Обычно безопаснее принимать эти четыре противотуберкулезных препарата перорально плюс левофлоксацин в течение 2 недель до операции. После операции необходимо принимать противотуберкулезные препараты в течение 18 месяцев. В течение этого периода необходимо ежемесячно проверять функции печени и почек, и если функция печени нарушена, необходима печеночно-защитная терапия и, при необходимости, смена противотуберкулезных препаратов. Алкоголь в этот период строго запрещен во избежание повреждения печени. Существуют короткие курсы медикаментозного лечения, но они чреваты рецидивами и вызывают лекарственную устойчивость, поэтому не многие врачи используют короткие курсы противотуберкулезного лечения. Все больше врачей используют длительный курс противотуберкулезного лечения для обеспечения эффективности. За последние 10 лет ежегодно около 100 — 140 случаев спинального туберкулеза лечились длительным курсом лечения, при этом не было ни одного случая устойчивости туберкулеза и 99% пациентов излечивались. Большинство случаев рецидива связано с тем, что пациенты не принимают регулярно противотуберкулезные препараты после операции, короткая продолжительность лечения; или неполное удаление поражения во время операции.