К первым относятся пациенты с четким диагнозом гипертрофической кардиомиопатии, имеющие выраженные симптомы и неудовлетворительную или неэффективную лекарственную терапию; значительную обструкцию пути оттока левого желудочка за счет передней створки митрального клапана и утолщенного миокарда пути оттока левого желудочка с разницей давления более 50 мм рт. ст.; толщину межжелудочковой перегородки более 15 мм; возраст более 21 года; пациенты, не поддающиеся хирургическому лечению или категорически отказывающиеся от него. Частота возникновения атриовентрикулярной блокады третьей степени после спиртовой аблации высока, причем у 50% пациентов блокада носит преходящий характер, а еще 10-20% требуют установки постоянного кардиостимулятора.