Существует пять патологических подтипов медуллобластомы: классический, десмопластический, MBEN, крупноклеточный и анапластический. Прогноз лучше для профибробластического и обширного узлообразующего типов, которые чаще встречаются у пациентов в возрасте до 5 лет и взрослых и имеют относительно хороший прогноз; наихудший прогноз для крупноклеточного и мезенхимального типов медуллобластомы. Поскольку оба типа имеют плохой прогноз, мы обычно называем их LC/A типами. Частота встречаемости медуллобластомы LC/A низкая, и из пяти подтипов медуллобластомы LC/A типы составляют наименьшую долю и имеют самый плохой прогноз. Прогноз классической медуллобластомы, с другой стороны, более вариабелен и не поддается оценке. Клиническое значение этих пяти патологических подтипов относительно и не может быть абсолютизировано, а их точность ниже, чем у молекулярного типирования.