Большинство эмбриональных рабдомиосарком очень чувствительны к радиотерапии и могут быть подвергнуты радиотерапии в течение 1 недели после операции для тех, кто перенес хирургическую резекцию. Для детей со значительной инвазией основания черепа, которым требуется срочная радиотерапия, радиотерапия может быть проведена до химиотерапии. Если опухоль слишком велика для операции, рекомендуется радиотерапия. Частичная радиотерапия может быть рассмотрена, если первичная опухоль расположена в жизненно важном органе, который не может быть удален хирургическим путем. Эмбриональная рабдомиосаркома требует сочетания таких методов лечения, как хирургия, радиотерапия и химиотерапия. Радиотерапия является очень важной частью лечения, включая внешнюю радиотерапию и имплантацию частиц. Современные руководства рекомендуют не проводить радиотерапию при эмбриональной рабдомиосаркоме I стадии и радиотерапию при эмбриональной рабдомиосаркоме II-IV стадий. Аденоидная рабдомиосаркома имеет местный рецидив, поэтому при всех стадиях I-IV требуется лучевая терапия.