Хотя катетерная абляция менее инвазивна, чем хирургические процедуры, и имеет четкий результат, существует вероятность осложнений, как и при любом клиническом лечении, особенно инвазивном. Осложнения, характерные для всех процедур катетерной абляции, можно условно разделить на 3 области: пункция сосудов, манипуляции с катетером и процесс абляции. К осложнениям пункции сосудов относятся гематомы, тромбоз глубоких вен, артериовенозные фистулы и гемопневмоторакс. Некоторым пациентам с аритмиями во время операции требуется пункция межпредсердной перегородки. Основным осложнением пункции межпредсердной перегородки является тампонада перикарда вследствие перфорации сердца. Перфорация сердца, приводящая к тампонаде перикарда, также является возможным осложнением процедур катетеризации и абляции. Виды осложнений во время катетеризации и абляции также могут различаться между различными видами терапии абляции аритмии и описаны в следующих монографиях. Катетерная абляция является относительно хорошо зарекомендовавшим себя методом лечения аритмий, и с научной точки зрения возникновение осложнений не является абсолютно предотвратимым, но шансы относительно невелики. Преимущества абляции значительно перевешивают возможные риски, поэтому этот метод лечения пропагандируется, популяризируется и развивается, а пациентам не приходится слишком беспокоиться об осложнениях во время консультации и процесса лечения. В целом, пациенты могут быть уверены, что их врач хорошо осведомлен о возможных осложнениях на каждом этапе процедуры и прилагает все усилия, чтобы свести их к минимуму.