Внедрение магнитной стимуляции центральной нервной системы Баркером и др. в 1985 году вывело моторные вызванные потенциалы из эпохи невыносимой транскраниальной электростимуляции в эпоху безболезненной и неинвазивной транскраниальной магнитной стимуляции, которая сегодня регулярно используется в клинической практике и является незаменимым нейрофизиологическим методом диагностики и прогностической оценки многих неврологических заболеваний. Транскраниальная магнитная стимуляция моторных вызванных потенциалов в настоящее время является единственным жизнеспособным нейрофизиологическим инструментом для оценки состояния центральной двигательной нервной системы. В основном он используется для диагностики неврологических заболеваний, связанных с двигательной функцией (например, болезнь двигательных нейронов, рассеянный склероз), и для прогнозирования исхода (например, ишемическая цереброваскулярная болезнь). Первые отчеты о случаях применения повторной транскраниальной магнитной стимуляции (ПТМС) при депрессии были опубликованы в 1993 году, а первая статья о применении ПТМС при болезни Паркинсона была опубликована в 1994 году. Первая статья о болезни Паркинсона была опубликована в 1994 году, и с тех пор появилось множество исследований по ишемической цереброваскулярной болезни, когнитивной дисфункции (деменции), тревоге, обсессивно-компульсивным расстройствам, мигрени и даже трудноизлечимой эпилепсии, а также афазии, дисфагии, шуму в ушах и другим заболеваниям.