Киста шишковидной железы является одним из видов внутричерепного окклюзирующего поражения, и все операции при внутричерепных окклюзирующих поражениях должны, во-первых, обеспечить пациенту соответствующее положение, благоприятное для хирургического вмешательства. Во-вторых, необходимо выбрать подходящий хирургический подход, т.е. вид хирургического разреза, позволяющий более полно обнажить опухоль и облегчить операцию. Наконец, после того как разрез сделан, череп рассекается, и только после рассечения черепа следующим шагом является рассечение слоя мозговой ткани, окруженного менингами, обычно называемыми твердой мозговой оболочкой, для того чтобы четко открыть поле зрения и облегчить операцию, а затем окончательно разделить слои один за другим, чтобы добраться до места поражения и резецировать опухоль. Для проведения операции требуется общая анестезия и тщательный контроль жизненно важных показателей пациента во время операции.