Основу лечения микоплазменной пневмонии составляет назначение противовоспалительных препаратов против Mycoplasma pneumoniae, для чего обычно требуется 2-недельный курс лечения, причем большинство из них удается полностью излечить. Препаратами выбора являются макролиды, включая эритромицин, азитромицин и кларитромицин, и хинолоны, такие как гатифлоксацин, левофлоксацин, ципрофлоксацин, офлоксацин, флерофлоксацин и ломефлоксацин. Как правило, при приеме этого препарата могут возникать побочные реакции, наиболее распространенной из которых является раздражение желудочно-кишечного тракта, такое как тошнота, рвота или даже боли в животе, диарея; в это время можно, исходя из побочных реакций пациента, корректировать дозировку препарата, а при необходимости и тип препарата, но также можно назначать витамин В6, пробиотики и т.д. для борьбы с побочными эффектами.