Пробиотики не лечат плесень, которая по-прежнему лечится обычными противогрибковыми препаратами. Хотя плесневая инфекция связана с нарушением функционирования вагинальной флоры, пробиотики не способны улучшить среду обитания вагинальной флоры, поэтому они не оказывают влияния на лечение плесневого вагинита. Женщинам, инфицированным микобактериями, необходимо систематическое и стандартизированное применение противогрибковых препаратов, включая системные и топические, под руководством врача. Системная терапия предполагает пероральный прием противогрибковых препаратов, а местная — в основном вагинальные пробки и топические лосьоны. В процессе лечения нельзя сожительствовать, также необходимо уделять внимание гигиене. Одновременно с этим половому партнеру, имеющему симптомы заболевания, рекомендуется также пройти совместное лечение для снижения вероятности рецидива.