В большинстве случаев кисты почек не имеют явных симптомов, но если диаметр кисты достигает 10 см и более, то у пациентов появляются симптомы, основным из которых является боль в боку или спине. При кровотечении или разрыве кисты почки стенка кисты расширяется, перикард сдавливается или растягивается, что может привести к сильным болям в пояснице. Если в кисту попадает инфекция, то помимо боли появляется лихорадка и общие мышечные боли, тошнота и рвота. Обычно кисты почек не вызывают гематурии, но в некоторых случаях, если киста сдавливает почечную паренхиму, это может привести к повышению артериального давления, что чревато головокружением и головной болью.