Вагинальное УЗИ во время менструации позволяет определить количество синусных фолликулов, что позволяет судить о базальном состоянии яичников. При нормальной функции яичников количество синусных фолликулов составляет ≥9 билатерально и <12 унилатерально. Если суммарное количество синусных фолликулов менее 7, то это признак гипоплазии яичников, а если количество синусных фолликулов ≥12 в одностороннем порядке, то в совокупности с эндокринологическим обследованием пациентки и симптомами нерегулярных менструаций и бесплодия это расценивается как синдром поликистозных яичников (PCOS), и при подозрении на синдром поликистозных яичников пациентке необходимо провести лечение индукцией овуляции для наступления беременности. Выстилка эндометрия во время менструации относительно тонкая, обычно 2-3 мм толщиной, если во время менструации выстилка эндометрия толще, то после окончания менструации следует повторить УЗИ, а при подозрении на полип эндометрия необходимо провести гистероскопию, поэтому пациенткам с бесплодием необходимо часто проводить УЗИ во время менструации.