МРТ при головокружении лучше, чем КТ. Точный выбор исследования зависит от того, какие заболевания являются основной причиной головокружения, и в основном исключает органические заболевания. Органические заболевания, которые могут вызывать головокружение, — это в основном поражения задней системы кровообращения, такие как транзиторные ишемические атаки в задней системе кровообращения, инфаркты, кровоизлияния в задней системе кровообращения, а также воспаления и опухоли в стволе мозга или вблизи мозжечка. Предпочтение отдается МРТ, поскольку при КТ плохо видны мозжечок и ствол мозга, часто присутствуют артефакты, а разрешение снимков низкое, что затрудняет четкое определение воспаления и инфаркта. МРТ позволяет четко различить инфарктные поражения в острой стадии, обнаружить мелкие очаги, которые невозможно выявить с помощью КТ, а также провести дополнительное исследование с усилением у пациентов с подозрением на опухоль или воспаление для дифференциальной диагностики.