Функциональные ортодонтические аппараты применяются в основном при функциональной мальокклюзии, вызванной нарушением функции мышц орофациальной области. Кроме того, ранняя костная мальокклюзия также может быть использована, если она способствует нормальной функциональной деятельности лица и создает благоприятные условия для развития черепно-лицевого скелета и зубов; функциональные ортодонтические аппараты лучше всего начинать применять за 1-2 года до начала пубертатного роста и прорезывания зубов и продолжать в течение всего периода прорезывания. У китайских детей женщины вступают в период прорезывания в среднем в 9-10 лет, а мужчины — в 12-13 лет. Учитывая возраст зубов, функциональные ортодонтические аппараты применяются в основном для пациентов в периоде смены зубов, но могут использоваться также при молочных и ранних постоянных зубах. Когда рост лица практически завершен, их эффективность существенно ограничивается. Функциональные ортодонтические аппараты в основном используются для коррекции диспропорции длины, как при неправильном (прикусе) класса Anser II, так и при неправильном (прикусе) класса Anser III; неправильные (прикусы) функциональные ортодонтические аппараты могут также использоваться для коррекции диспропорции высоты, что более эффективно при глубоких надзубных протезах (прикусах), а также при открытых прикусах. Кроме того, функциональные ортодонтические аппараты могут использоваться для коррекции диспропорции высоты боковых зубов, но не подходят для скученности зубов, смещения зубов и случаев удаления зубов. При необходимости функциональные аппараты могут использоваться в сочетании с механическими аппаратами для выравнивания зубов.