Высокое содержание кальцитонина может вызвать такие состояния, как тошнота, рвота, гиперемия лица, онемение и покалывание в руках. Другие побочные эффекты включают кожную сыпь, неприятный вкус во рту, боли в животе, частое мочеиспускание и дрожь. В месте инъекции также могут возникать воспалительные реакции. При длительном применении в крови могут вырабатываться антитела, которые обычно не влияют на эффективность и остаются эффективными после развития толерантности к кальцитонину животного происхождения и кальцитонину взрослых. Другие побочные реакции включают головную боль, озноб, давление в груди, слабость, головокружение, заложенность носа, одышку, боль в глазах, отеки нижних конечностей и необходимость быть внимательным при подергивании конечностей, вызванном низким содержанием кальция в крови.