Хирургический подход к лечению врожденной гиперинсулинемии также вызывает большую озабоченность у родителей. В зависимости от гистологического типа поджелудочной железы существует два основных варианта хирургического лечения врожденной гиперинсулинемии: частичная панкреатэктомия и субтотальная панкреатэктомия. Первый вариант подходит для детей с очаговой ХИ, когда удаляется только часть поджелудочной железы, содержащая очаговое поражение, и прогноз для этого типа пациентов обычно лучше. Субтотальная панкреатэктомия используется у детей с диффузной ХИ, при которой удаляется примерно 95-97% поджелудочной железы. Исход и послеоперационный исход у детей с этим типом ИБС более сложный, и после операции по-прежнему требуется длительное клиническое наблюдение и контроль.