Для проведения гастроскопии не всегда требуется биопсия. Для проведения гастроскопии необходимо поэтапное систематическое и всестороннее обследование верхних отделов желудочно-кишечного тракта, в ходе которого обнаруженные аномальные поражения сначала оцениваются под прямым зрением. Гастроскоп оснащен камерой, которая передает на экран изображения соответствующих участков желудка, то есть, есть ли изменения в слизистой оболочке в каждой области, и врач может судить о поражении прямым зрением, прежде чем принять решение о необходимости проведения биопсии. Если было замечено явное, очень типичное проявление рака желудка и в данный момент безопаснее взять биопсию, необходимо получить патологическую ткань для биопсии и окончательной диагностики опухоли, т.е. получить патологоанатомический диагноз. Однако при некоторых заболеваниях, не требующих биопсии, таких как гастрит или легкая язва желудка, нет необходимости брать биопсию эндоскопически. Взятие биопсии имеет огромное значение, поэтому при сложных, относительно редких заболеваниях эндоскопическая биопсия все же рекомендуется для получения патологического диагноза.