Любая операция сопряжена с определенными рисками, и хирургическое лечение тетралогии Фаллота сопряжено с теми же рисками анестезии, экстракорпорального кровообращения и осложнений, связанных с операцией, что и любая другая процедура. Однако в настоящее время хирургическая техника хорошо отработана, и смертность детей с чистой тетралогией Фаллота составляет от 2% до 3%. Дети младше 3 месяцев и старше 4 лет, а также дети с гипоплазией легочной артерии подвержены высокому риску хирургического вмешательства. В целом, однако, операция является наиболее важным методом лечения тетралогии Фаллота, и преимущества значительно перевешивают риски, если ребенок подходит для операции.