Китайская медицина имеет побочные эффекты, длительное применение китайской медицины приведет к побочным эффектам зависимости, поэтому обычно пьют 1 неделю или около того, необходимо изменить рецепт. Например, семена кассии обладают эффектом снижения уровня жиров в крови, но длительное применение семян кассии может вызвать расстройство желудка. Благотворное воздействие на селезенку и ци, очищение от жара и детоксикацию сена длительное применение приведет к повышению артериального давления. Именно по этой причине «лекарства трижды ядовиты». Большинство китайских лекарств — это природные лекарства, действующие вещества которых имеют более сложный состав, например, алкалоиды, сапонины, дубильные вещества, летучие масла и т.д. Поскольку это лекарственные средства, большинство из них будет иметь различные степени побочных эффектов. В целом побочные эффекты традиционной китайской медицины меньше, чем синтетической западной, но есть и препараты с большей токсичностью, например, красный мышьяк, белый мышьяк, ртуть, занбянь, червь циннянь, красный жук, сырая гарциния камбоджийская и т.д. Чуть менее токсичны: белый аконит, сырой аконит, сырой чуаньву, сырой каову, сырой полусумрак, стрихнин, кротон, сырой тяньнаньсин, сырой гансуй, цветок козлятника, тяньсяньцзы, жабник, земляная лесная черепаха, лусонго, облачные валы, кленовые баклажаны, кленовый баклажан, сырая сера, кротон, белый нисходящий дань, маковая шелуха и т.д. При применении этих препаратов необходимо соблюдать осторожность, например, клен перед цветением вымачивают в вине, перорально лечат ревматоидный артрит, доза слишком велика, часто вызывает смерть от отравления. Поэтому ядовитые травы необходимо принимать под руководством врача.