Нетуберкулезные микобактерии не заразны и не являются инфекционными заболеваниями. Антацидное окрашивание положительно в основном для Mycobacterium tuberculosis и нетуберкулезных микобактерий. Mycobacterium tuberculosis является инфекционным заболеванием и вызывает в основном легочный туберкулез, который передается воздушно-капельным путем. Пациенты должны лечиться в изоляции, а период лечения относительно длительный, не менее шести месяцев. Нетуберкулезные микобактерии не являются инфекционными, но они требуют регулярного противоинфекционного лечения, а рецидивы заболевания могут еще больше усугубить его, даже вызвать такие проявления, как дыхательная недостаточность. Период лечения нетуберкулезных микобактерий короче, чем туберкулезных, — около 2-3 месяцев.