HBV — это гепатофильный ДНК-вирус с геномом длиной около 3,2 кб, который частично представляет собой двухцепочечную циклическую ДНК. HBV устойчив, но HBV может быть инактивирован кипячением при 65°C в течение 10 ч, кипячением в течение 10 мин или паром высокого давления. Этиленоксид, глутаральдегид, пероксиуксусная кислота и йодоформ также оказывают хорошее инактивирующее действие на HBV. После проникновения HBV в гепатоциты часть двухцепочечной циклической ДНК HBV используется в ядре для удлинения положительной цепи с отрицательно заряженной ДНК в качестве шаблона для восстановления области расщепления в положительной цепи, образуя ковалентную замкнутую ДНК (cccDNA); затем cccDNA используется в качестве шаблона для транскрипции в несколько мРНК различной длины, которые используются в качестве прегеномной РНК и кодируют различные антигены HBV. (У ккДНК длительный период полураспада, и ее трудно полностью вывести из организма. Установлено, что ВГВ имеет 9 генотипов, А-I, причем в Китае преобладают типы С и В. Генотип HBV связан с прогрессированием заболевания и эффективностью терапии интерфероном альфа. По сравнению с инфицированными генотипом С, инфицированные генотипом В раньше обнаруживают серологическую конверсию HBeAg и реже прогрессируют до хронического гепатита, цирроза и первичной гепатоцеллюлярной карциномы.