В раннем подростковом и раннем репродуктивном возрасте, когда происходит метаплазия сквамозного эпителия, инфекция вирусом ВПЧ может вызвать изменения в новых трансформированных клетках, и вирусные частицы могут интегрироваться в ДНК клеток человека. Если вирус сохраняется, это может привести к предраковым поражениям, а позже клетки теряют свою нормальную регуляцию и становятся раковыми. Время от заражения ВПЧ до развития рака варьируется. Шестьдесят или более процентов случаев легкой атипичной гиперплазии разрешаются спонтанно, и только около 10% развиваются в умеренную или тяжелую атипичную гиперплазию в течение 2-4 лет. В некоторых случаях умеренной или тяжелой атипичной гиперплазии может не понадобиться проходить через легкую атипичную гиперплазию. Менее 50% случаев тяжелой атипической гиперплазии могут перейти в инвазивную карциному, а у молодых женщин шансы на развитие инвазивной карциномы еще ниже. Обычно легкая атипичная гиперплазия перерастает в рак только после естественного прогрессирования в течение 10-20 лет. Таким образом, рак шейки матки можно предотвратить на относительно ранней стадии, создав условия для скрининга.