Существует два основных метода лечения множественных кист печени, один из которых — чрескожная чреспеченочная пункция и дренирование кисты под контролем УЗИ, этот вид операции применяется в основном при одиночных кистах печени, обычно диаметр кисты при УЗИ составляет более 5 см, что позволяет проводить данный вид лечения, а в конце дренирования кистозной жидкости через катетер вводится безводный спирт для дальнейшего разрушения стенки кисты. Другой вид лечения — лапароскопическая декапитация и дренирование печеночных кист, этот вид операции подходит для множественных кист в печени, и большинство кист расположены на поверхности печени, под прямым наблюдением лапароскопии, в самом нижнем положении печеночных кист без кровеносных сосудов, удаляют часть стенки кисты и помещают перитонеальный дренаж, так что печеночные кисты пациента могут быть в основном вылечены примерно через 3-6 дней после дренирования. Для наблюдения за кистами печени пациенты должны регулярно, раз в полгода или раз в год, проводить УЗИ верхних отделов брюшной полости, в зависимости от изменения диаметра кисты, и решать, лечить или нет, если кисты менее 5 см, то можно продолжать наблюдение, если диаметр кист более 5 см, то пациенту рекомендуется рассмотреть два вышеуказанных метода лечения.