Целиакия с кишечной метаплазией трудно поддается лечению, поскольку кишечная метаплазия трудно поддается обратному развитию, но ее можно контролировать с помощью активного лечения, чтобы контролировать прогрессирование заболевания и улучшить прогноз заболевания. Причиной целиакии желудка с кишечной метаплазией в основном является инфекция Helicobacter pylori и другие факторы. Для уничтожения Helicobacter pylori можно принимать такие препараты, как кларитромицин, амоксициллин, омепразол, висмута цитрат калия. При отсутствии инфекции H. pylori можно принимать такие препараты, как омепразол и магния алюминия карбонат. После активного медикаментозного лечения можно эффективно замедлить прогрессирование заболевания и предотвратить атрофию слизистой оболочки желудка. При возникновении побочных реакций во время применения препаратов необходимо своевременно обратиться за консультацией, а также не допускать развития лекарственной аллергии.