Йодофор не следует использовать с красной ртутью, которая также известна как красный физраствор. При смешивании йодофора с красной ртутью образуется йодид ртути, который является токсичным препаратом и при наружном применении на ране может всасываться в рану и попадать в кровоток, приводя к системным токсическим реакциям. Обычно йодофор применяется местно или после многократного промывания раны перекисью водорода или физраствором, затем дезинфицируется йодофором, или может быть наложен влажный компресс из йодофора. Кроме того, йодофор наиболее эффективен при нанесении на некоторые слизистые оболочки кожи, особенно промежности, и меньше раздражает слизистые оболочки.