Чаще всего эмбриональный аборт происходит в течение 12 недель беременности, то есть в начале триместра. Поскольку на ранних стадиях беременности эмбрион не очень плотно прикреплен к матке, любые неблагоприятные факторы, такие как неблагоприятные внешние раздражители, влияние лекарств, эмоциональные взлеты и падения, наличие материнских факторов, таких как преклонный возраст при первых родах, высокое кровяное давление, системные заболевания, такие как нарушения иммунной системы и системы крови, а также плохое местное кровообращение, могут привести к прерыванию беременности. Кроме того, процесс зачатия характеризуется выживанием сильнейшего. Эмбриональный аборт может также произойти, если у обоих супругов некачественная сперма или яйцеклетки, хромосомные аномалии, плохо развитые ворсины хориона или генетические нарушения, которые приводят к плохому эмбриональному развитию.