Специфического лечения тиреоидита Хашимото не существует. Клиническое лечение направлено на устранение симптомов гипотиреоза и компрессии зоба, которые могут лечиться медикаментозно или хирургически. Ограничение потребления йода может помочь остановить прогрессирование аутоиммунного разрушения щитовидной железы. Люди, у которых имеется только зоб и нет гипотиреоза, как правило, не нуждаются в лечении. Заместительная терапия левотироксином назначается в основном при клиническом или субклиническом гипотиреозе. При быстром увеличении щитовидной железы, сопровождающемся локальными болевыми или давящими симптомами, может быть назначена глюкокортикоидная терапия. Хирургическое вмешательство может быть рассмотрено, если симптомы сдавления очевидны и не снимаются медикаментозными средствами, но при этом высока вероятность развития послеоперационного гипотиреоза. Больные тиреоидитом Хашимото должны своевременно обращаться к врачу для проведения комплексного лечения, а также регулярно контролировать функцию щитовидной железы, чтобы не затягивать состояние.