Основной целью мониторинга фолликулов является определение дня овуляции, руководство половым актом и повышение шансов на зачатие. Другой тип мониторинга фолликулов применяется у пациенток, проходящих ЭКО, когда развитие фолликулов отслеживается после введения лекарств и извлечения яйцеклеток в нужное время, что чаще всего происходит во время стимулирования овуляции. В случае пациентки с нерегулярными месячными или поликистозом яичников врач часто проводит мониторинг овуляции, основная цель которого — увидеть, как фолликулы растут от маленького к большому до момента их изгнания, а также определить день овуляции и направить половой акт для повышения шансов на зачатие. В случае с пациентами, проходящими ЭКО, во время процесса стимулирования овуляции необходимо также следить за процессом развития фолликулов после приема лекарств, требуя, чтобы фолликулы развивались параллельно, и определять время забора яйцеклеток, когда они созреют, чтобы максимально увеличить количество яйцеклеток и затем провести экстракорпоральное оплодотворение для формирования эмбрионов для переноса, чтобы увеличить шансы на зачатие.