Анестетики оказывают побочное воздействие на организм, поскольку являются препаратами, действие которых направлено на нервную систему, и могут оставаться в клетках головного мозга в течение длительного времени после наступления эффекта анестезии или сна. К побочным эффектам анестетиков относятся сонливость, спутанность сознания, перепады настроения и ненормальное мышление, они могут вызывать аллергические реакции и другие побочные эффекты. Побочные эффекты характерны для всех лекарственных средств, но при использовании квалифицированных препаратов они обычно исчезают относительно быстро, а благодаря метаболическому циклу лекарственного средства они не оказывают пожизненного влияния на пациента после применения. Большинство анестетиков воздействуют на организм лишь в течение короткого времени, по истечении периода полураспада препарата его действие исчезает, и пациент может жить обычной жизнью. Если не произойдет серьезной аварии при проведении анестезии, жизнь пациента может быть вне опасности.