Тяжесть фокального сегментарного гломерулонефрита в основном зависит от степени его патологического поражения и реакции пациента на медикаментозную терапию, а эффект лечения фокального сегментарного гломерулосклероза в целом ниже по сравнению с другими типами патологии. При фокальном сегментарном гломерулосклерозе большинство пациентов плохо реагируют только на глюкокортикоиды, а комбинация иммунодепрессантов может быть эффективной у некоторых пациентов, но наступление эффекта более длительное. Если удается достичь ремиссии заболевания почек, то прогноз относительно благоприятный. Однако при сохранении ремиссии более половины пациентов в течение 6-10 лет переходят в стадию конечной стадии болезни почек, или уремии. Пациенты с фокальным сегментарным гломерулосклерозом составляют около 10% всех заболеваний почек в Китае, причем преобладают они среди мужчин-подростков.