При несварении желудка пища выводится в полупереваренном состоянии, и билирубин в фекалиях окисляется не щелочными веществами, а билирубином в кислой среде, в результате чего они приобретают черно-зеленый цвет. При несварении желудка фекалии содержат много непереваренной пищи и поэтому имеют кислый запах. Когда в кишечнике растет Pseudomonas aeruginosa, она вступает в реакцию с остатками пищи и вызывает неприятный запах и зеленоватый цвет фекалий. При кровотечении в пищеварительном тракте часть крови выделяется через пищеварительный тракт, где она окисляется и образует черные фекалии, которые также имеют неприятный запах и, в некоторых случаях, дегтеобразный стул.