Желчный рефлюкс лечат медикаментами, включая следующие: 1) препараты для улучшения моторики желудочно-кишечного тракта, такие как морфолин; 2) пероральные препараты для защиты слизистой желудка, такие как Даксил; 3) кислотоподавляющая терапия, включая блокаторы H2-рецепторов и ингибиторы протонной помпы, в том числе ранитидин и локсациллин; 4) проверка на наличие H. pylori, и если это так, лечение H. pylori. В целом, желчный рефлюкс следует лечить медикаментами в дополнение к диете. Если медикаменты неэффективны и желчный рефлюкс очень тяжелый, нельзя исключать хирургическое вмешательство.