Цветное УЗИ обычно не выявляет проблем с кишечником. Цветное УЗИ хорошо распознает поражения паренхимальных органов, таких как щитовидная железа, печень, сердце, селезенка и почки, но подвержено газовым помехам. Органы с большим количеством газовых помех распознаются хуже, например, легкие или кавернозные органы. Ультразвук позволяет осмотреть желудок и двенадцатиперстную кишку, но только после перорального введения большого количества специальной контрастной жидкости, чтобы получить общее представление о морфологии слизистой оболочки двенадцатиперстной кишки и наличии каких-либо окклюзионных поражений. Однако диагностика локализованного воспаления с его помощью малоэффективна, кроме того, в кишечнике больше кишечного газа и большое количество кишечного содержимого, поэтому УЗИ обычно не осматривает кишечник. Для исследования желудочно-кишечного тракта предпочтительнее гастроскопия. Для особых областей или в случаях, когда эндоскопия противопоказана, доступны капсульная гастроскопия, рентгеноскопия всего желудочно-кишечного тракта с барием и компьютерная томография брюшной полости.