Ферменты обычно делятся на простые и связанные ферменты, не все из которых являются белками. Не все ферменты являются белками, но большинство из них — белки, например, простые протеазы, которые состоят в основном из белков. Связанные белковые ферменты образуются при соединении белкового компонента с небелковым. Только ферменты с таким сочетанием веществ могут быть биологически активными и являются связанными ферментами, также известными как холоферменты. Ферменты, состоящие из чистых белков, в основном состоят из белков.