У некоторых тяжелобольных, пожилых и ослабленных пациентов при кашле мокрота плохо откашливается, легко задерживается в бронхиальных трубах, что приводит к усугублению дыхательной недостаточности, а легочная инфекция трудно поддается лечению. В это время для отсасывания выделений в трахее часто приходится прибегать к бронхоскопии, однако при бронхоскопическом отсасывании могут возникнуть следующие побочные эффекты. Первый и наиболее распространенный — кашель с кровью, который возникает в результате травматического кровотечения из стенки трахеи при неправильном введении или грубом обращении с бронхоскопом, а также при сильном кашле пациента. Вторая — гипоксемия, возникающая при раздражении гортани и трахеи и спазме, вызванном процедурой трахеоскопии, и проявляющаяся в виде гипоксии. Кроме того, существуют кардиологические осложнения: у пациентов чаще всего наблюдается учащение пульса, аритмия и редко — остановка сердца. Кроме того, небольшое число пациентов, особенно с хронической обструктивной болезнью легких и пожилых, подвержены распространению инфекции и лихорадке во время трахеоскопической ирригации и аспирации мокроты.