Диагноз эндокардита должен быть поставлен на основании симптоматики и дополнительных исследований.
Клинически, у пациентов наблюдается лихорадка различной степени выраженности с нерегулярной и продолжительной лихорадкой, наряду с хронической усталостью, ночной потливостью, потерей аппетита, потерей веса, болью в суставах и бледностью кожи; наличие шумов и более громких сердечных проявлений; или наличие болей в животе, гематурии и т.д., в сочетании с результатами анализа крови на наличие бактерий и результатами ультразвукового исследования сердца на наличие аномальных клапанов с избыточными организмами, обычно являются диагностическими.