В целом ВПЧ можно разделить на более чем 160 подтипов, которые в свою очередь делятся на два основных типа, которые можно классифицировать как вирусы низкого и высокого риска. Вирусы ВПЧ низкого и высокого риска вызывают различные заболевания и отличаются по своей патогенности. Вирусы ВПЧ низкого риска часто приводят к появлению генитальных бородавок и широко известны как ВПЧ6 и ВПЧ11. Длительная персистирующая инфекция вирусами ВПЧ высокого риска может привести к злокачественным поражениям шейки матки. Патогенность вирусов ВПЧ высокого риска также различна: наиболее патогенными являются ВПЧ16 и ВПЧ18, которые могут вызывать 70% случаев рака шейки матки, а ВПЧ типов ВПЧ31, ВПЧ33, ВПЧ52 и ВПЧ58 также чаще встречаются у азиатских женщин.