Выбор глаза для операции при альтернирующей эзотропии зависит в основном от величины косоглазия, и в небольшом диапазоне степеней пациент может выбрать один глаз. При альтернирующем косоглазии или других видах косоглазия выбор операции на одном глазу или на обоих зависит от величины косоглазия. При косоглазии 15 градусов и менее операция по коррекции одной мышцы на одном глазу позволяет добиться лучших результатов при меньшем повреждении глаза и более быстром восстановлении. Если степень косоглазия больше, примерно до 30 градусов, то из-за того, что длина одной мышцы может быть укорочена, а количество исправляемых градусов ограничено, приходится выбирать для операции оба глаза или несколько экстраокулярных мышц. Пациентам с косоглазием рекомендуется своевременно обращаться к врачу для оценки своего состояния и выбора подходящего лечения по рекомендации врача.