Мизопростол вызывает боль в нижней части живота примерно через 20 минут после приема препарата, в основном потому, что он вызывает сокращение матки, чтобы продукты беременности могли быть изгнаны, и небольшое вагинальное кровотечение возникает вскоре после появления боли в животе. Продукты беременности изгоняются через 2-6 часов после приема мизопростола. Кроме того, из-за индивидуальных особенностей у некоторых людей примерно через десять минут после приема мизопростола может возникнуть аллергическая реакция, например, мелкая красная сыпь, которая может появиться на внутренней стороне ладоней обеих рук, в этом случае пациент может почувствовать зуд на ладонях. Если симптомы тяжелые, клинически показано противоаллергическое лечение.