Наиболее часто поражаются митральный и аортальный клапаны. Инфекционный эндокардит возникает при инфицировании выстилки сердца микроорганизмами, образующими избыточные организмы. Поскольку микроорганизмы часто следуют за потоком крови из полости с высоким давлением в полость с низким давлением, проходя через отверстия клапанов, у пациентов с клапанными заболеваниями из-за недостаточности закрытия митрального клапана, аортального клапана, вызванной полостью с низким давлением в кровотоке, перфузия кровотока относительно низкая, для роста микроорганизмов и отложения благоприятные условия, поэтому микроорганизмы в двух основных клапанах задерживаются, откладываются, что приводит к микробным инфекциям и образованию избыточных организмов, поэтому в этих двух отделах сердца наиболее часто встречаются инфекционные заболевания.