При хроническом энтерите пробиотики играют определенную роль, но не могут полностью вылечить хронический энтерит, но также должны сочетаться с другими лекарственными средствами, могут быть полностью излечены. У больных хроническим энтеритом, имеющих дисбаланс кишечной флоры, целесообразно употреблять пробиотики для снятия симптомов, что дает определенный эффект. Обычно используются такие пробиотики, как Bacillus subtilis bifidus granules, Bacillus licheniformis live bacteria, Bacillus subtilis enterococci bifidus multivitamin granules. При приеме гранул Bacillus subtilis dictyostelium возможно редкое увеличение частоты диареи. При приеме высоких доз живых бактерий Bacillus licheniformis может возникнуть запор. При приеме гранул Bacillus subtilis Enterococcus Dichotomus Multivitamin Granules возможно увеличение частоты диареи. Пробиотики не следует запивать кипяченой водой с температурой выше 40°C, а также принимать вместе с антибиотиками. Противопоказания к применению пробиотиков не уточнены. Пациентам с хроническим энтеритом рекомендуется обращаться за медицинской помощью и применять препараты под руководством врача, не заниматься самолечением.