Пробиотики могут регулировать кишечную флору и предотвращать диарею и запоры, а также укреплять сопротивляемость организма. Существует множество видов пробиотиков, таких как Lactobacillus, Bifidobacterium и Enterococcus, которые могут регулировать кишечную среду и полезны при диарее, вызванной несварением желудка или энтеритом, вызванным антибиотиками, а также для предотвращения запоров, кроме того, пробиотики могут способствовать пищеварению без каких-либо очевидных негативных последствий. При воздействии высоких температур пробиотики легко повреждаются, поэтому их необходимо хранить при низких температурах, обычно при 2-8°C в холодильнике, а температура воды для приема пробиотиков обычно не превышает 40°C. При использовании пробиотиков и антибиотиков их прием должен быть разделен на 1-2 часа. Обычно йогурт также содержит небольшое количество пробиотиков, при запорах его можно пить в умеренных количествах.