Не существует фиксированного времени развития резистентности к метронидазолу, оно зависит от физического состояния человека, дозы используемого препарата и вида возбудителя. Степень резистентности к пероральному метронидазолу зависит от физического состояния каждого человека, и некоторые люди могут быть подвержены индуцированной резистентности к метронидазолу. Кроме того, если при использовании метронидазола доза слишком велика или недостаточна, при этом не соблюдаются нормы, не соблюдается инструкция по применению, а некоторый курс использования не стандартизирован, поэтому также легко индуцировать выработку резистентности. Некоторые возбудители склонны к выработке резистентности к метронидазолу, например возбудители вагинальных инфекций, такие как трихомонады. Поэтому во избежание выработки резистентности необходимо регулярно применять метронидазол под руководством специалиста.