Поврежденные зубы мудрости могут быть удалены непосредственно при условии отсутствия противоположных зубов, образующих окклюзионные взаимоотношения. Если противоположные зубы находятся в правильном положении, то после удаления поврежденных зубов мудрости противоположные зубы могут постепенно удлиняться и образовывать щели с соседними зубами, что приводит к развитию кариеса после образования пищевых отложений, а иногда и к образованию суставной интерференции, приводящей к дисфункции височно-нижнечелюстного сустава. Поэтому их часто удаляют вместе. При небольших повреждениях зубов мудрости кариозные ткани могут быть удалены для восстановления полости, а стеклоиономерный цемент, амальгама и т.д. могут быть использованы для восстановления и заполнения полости с целью частичного восстановления жевательной функции. Если зубы мудрости имеют более глубокую полость и инфицированную пульпу, их лучше удалить, так как система корневых каналов зубов мудрости сложна и многообразна, а операционное пространство очень узкое, что затрудняет проведение лечения корневых каналов. Зубы мудрости можно удалять одновременно с зубами противоположной челюсти, чтобы не вызвать других повреждений.