Люмбальная пункция обычно не сопряжена с большим риском. Она предполагает проведение очень тонкой полой иглы через остистые отростки поясничных позвонков с сердечником в игле до самого поясничного бассейна, где спинномозговые нервы пропитаны спинномозговой жидкостью, и после извлечения сердечника жидкость выходит вместе с полой иглой, поэтому большого риска при люмбальной пункции нет. Однако есть ситуации, требующие особого внимания, например, люмбальную пункцию нельзя проводить при инфицированном участке, есть вероятность, что инфекция будет занесена в спинномозговую жидкость, что вызовет инфекцию головного мозга. Люмбальную пункцию нельзя проводить при особенно высоком внутричерепном давлении, так как это может вызвать и усугубить грыжу мозга, что может быть опасно для жизни. В большинстве случаев люмбальная пункция не представляет опасности. В некоторых случаях пункция может задеть спинномозговые и пояснично-крестцовые нервы, что может привести к их повреждению, но в большинстве случаев повреждения можно быстро устранить, и они обычно не вызывают серьезных проблем. Если процедура проводится в соответствии с обычными требованиями и не отличается особой грубостью, то серьезного риска обычно не возникает. Поэтому люмбальная пункция, как правило, является тестом, не представляющим большого риска.