Медикаментозный аборт может привести к некоторому повреждению слизистой оболочки матки, если аборт не является чистым. Остаточная ткань остается в полости матки, и если ее не удается вывести, то она может имплантироваться в полость матки, и тогда это не решается удалением матки, а требует госпитализации для проведения гистероскопической электрохирургии остаточной ткани. Наличие остаточных тканей в полости матки может стать причиной частых и нерегулярных вагинальных кровотечений, которые могут привести к инфицированию и, возможно, даже к анемии. Если остаток после медикаментозного аборта составляет менее одного сантиметра, то для приведения матки в нормальное состояние рекомендуется пероральный прием препаратов, способствующих кровообращению и устраняющих застой крови. Если же он составляет более одного сантиметра, то необходимо повторное очищение матки, чтобы остатки не существовали в полости матки длительное время, нанося вред организму и влияя на будущую беременность.