Считается, что подошвенные бородавки находятся на подошвах ног, поэтому, если количество бородавок на подошвах ног невелико и они не развиваются в течение длительного периода времени, их можно наблюдать некоторое время. Если бородавки большие или быстро развиваются, их следует лечить как можно скорее. Конкретные методы лечения включают местное применение геля с маслом желчи опия или замораживание жидким азотом, лазерное прижигание или ионтофорез — все три метода могут быть использованы для излечения бородавок в течение 7-10 дней. В качестве альтернативы можно делать местные инъекции полимиксина один раз в неделю в течение 3-5 недель, в зависимости от состояния пациента.