Перед началом лечения необходимо установить причину болей в щитовидной железе. Для анализа причины боли в щитовидной железе можно провести семь функциональных проб щитовидной железы, УЗИ щитовидной железы и анализ крови, а при необходимости — тонкоигольную аспирацию щитовидной железы и взятие биоптата для патологического исследования. Если абсцесс щитовидной железы вызван бактериальной инфекцией, то для борьбы с инфекцией можно использовать цефалоспорин или эритромицин, а при изъязвлении гноя — разрез и дренирование, а тиреоидит, вызванный вирусной инфекцией, можно лечить рибавирином и индометацином. При аутоиммунном тиреоидите можно использовать преднизон и индометацин, а при необходимости — циклофосфамид. Если боль вызвана злокачественной опухолью щитовидной железы, то необходимо как можно скорее удалить поражение щитовидной железы хирургическим путем, а для закрепления эффекта провести йод-131 и радиотерапию.