Анализ сывороточного альфа-фетопротеина в основном используется для диагностики рака печени. Заболеваемость раком печени растет, поэтому ранняя диагностика рака печени включает в себя не только анализ крови на сывороточный альфа-фетопротеин, но и визуализационные исследования, то есть УЗИ печени или КТ печени. При явном повышении уровня альфа-фетопротеина в сыворотке крови следует высоко оценивать возникновение рака печени. Рак печени часто возникает у людей, имеющих в семейном анамнезе рак печени, употребляющих большое количество алкоголя в течение длительного времени или имеющих в анамнезе хронический гепатит В. Трилогия хронического гепатита В, цирроза и рака печени. Анализ сывороточного альфа-фетопротеина также может быть использован для диагностики хронического гепатита или цирроза печени.