Основная цель тестов на генотипирование ВПЧ — различать конкретные типы ВПЧ-инфекции. ВПЧ не является единым вирусом, он имеет очень большое количество подтипов вирусов, в основном включающих ВПЧ6, ВПЧ16, ВПЧ58 и многие другие подтипы вирусов. При проведении обычного анализа на ВПЧ можно только определить, инфицированы ли вы ВПЧ, но тип ВПЧ, которым вы инфицированы, необходимо проверить с помощью генотипирования ВПЧ. Без генотипирования ВПЧ можно лечить только интерфероном широкого спектра действия, который сам по себе не особенно эффективен и склонен к лекарственной устойчивости. После проведения типирования вируса можно лечить его различными методами культуры клеток с антителами к вирусу в зависимости от типа вируса и после определения содержания вируса, что является более целенаправленным и более эффективным.